１９９７～１９９８年的厄爾尼諾現象是有觀測歷史以來最強的一次，對地球臭氧層造成了巨大、罕見的影響。赤道地區臭氧總量的負距平區主要分布在太平洋的中央地帶和東部，以及靠近格林威治子午線。在厄爾尼諾主要活動區第一次記錄到臭氧總量的短期（達幾天）活動，這種短期活動形成了特征尺度由幾百公里到幾千公里不等的臭氧總量最低值為２００～２２５ＤＵ的幾個負距平區。首次揭示出在熱帶個別地區厄爾尼諾及拉尼娜現象對臭氧總量及其距平符號的影響是很不一樣的。１９９７～１９９８年厄爾尼諾對地球臭氧層罕見而強烈的影響，是地球海洋－大氣系統全球氣候變化的一個證據。